经典入门 高级转录组分析和R数据可视化 (20259)

来源:bob官方体育 发布时间:2025-05-31 05:35:39 阅读: 1

  福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、临床基因组、单菌基因组、转录组线上线下同步开始(线上采用腾讯会议同步直播线下)。报名

  数据分析是相通的,通过一个简单的课程理解其中的原理,就可以推而广之,延伸到别的类型的数据分析,如扩增子、宏基因组、单细胞等。

  线上线下**同步开课,将系统讲述基于和不基于比对的转录组分析流程,从原始数据到表达矩阵、差异基因、转录组拼装、可变剪接、非编码RNA、ceRNA、转录因子调控网络、富集分析、加权共表达网络、通路分析、可视化绘图、机器学习等一系列常见操作,理论和实践兼备,为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个转录组分析学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析,独创四段式教学(2天集中授课+自行练习+讨论群讲解答疑+上课视频回看反复练习),“教—练—答—用”四个环节统一协调,真正的完成独立分析大数据。

  》。往期课程节选。部分视频可在B站空间免费查看:课程大纲请详细阅读课程简介,如果以下内容您全精通,不必参加此培训。

  下面是课程安排,本课程一共2天,每天6-8节课,共14节课,全部课程均理论与实战结合(只要课上讲的都是可以学会并自己实现的分析)。如11代表第一天第一节课,26代表第二天第六节课。更有多节视频课处理特定问题和后续的讨论群永久答疑。

  ceRNA分析 (miRNA-lncRNA-gene调控) [视频课程]

  服务器平台:没有软件的计算机只是一堆废铁,没有转录组分析系统的服务器也和你的数据分析没有半毛钱关系。想要搭建整套的转录组分析流程,网上的资源即零散、又稀少。易生信团队将分享多年经验摸索优秀软件和布置技巧,并

  ,让你在主流Linux服务器系统(Ubuntu 16/18.04,CentOS7等主流发行版)上快速布置专注组分析流程依赖的几十款常用软件、几百个依赖的R和Python包,轻松拥有专业分析平台。转录组分析计算需求不大,目前一台办公笔记本或工作站就能够完全满足要求。

  个人计算机平台:高通量测序所谓的大数据,都是在原始数据和分析过程中体量大,计算资源需求多,但结果文件不大。通常转录组分析会获得样品基因表达表、新转录本和非编码基因,这些表格是下游分析、高级分析以及个性分析的起点,绝大部分工作在我们的笔记本上是可以搞定的,只是很多人并不知道怎么入手。

  其实你的个人电脑就是数据表(丰度矩阵)统计分析的利器。易生信团队独创实现了跨平台的分析流程,在大家的Windows笔记本上可以轻轻松松实现转录组统计、可视化的绝大多数分析,课程带你轻松在自己的本本上搭建数据表统计分析与可视化平台,基于目前主流的Win10来优化和测试,让笔记本秒变数据分析可视化平台。

  有了生信分析平台,如何灵活运用还是要学点独门绝学的。21世纪最重要的是人才,人才最好掌握三门语言,将让你人生立于不败之地,在任何团队中都是不可或缺的人才。这三门语言就是中文、英文和计算机语言

  。中文每天都在用在学,英文对于博士也至少接触了10年以上并能应用于阅读和写作文献,而编程语言大家大学阶段都学过Visual Basic、Visual Foxpro、或C语言,但能在工作中应用的绝对凤毛麟角。更何况这些语言在生命科学领域是非常低效的,不提倡学习。生信中常用的三类语言是·Shell + R + Python/Perl·,前两门是基础,生物学家必要掌握的

  R语言基础知识,保证你完成项目分析。我们在课上将同时讲解生物学家必要掌握的Shell和R语言基础知识,保证你高效、稳定的使用转录组分析平台、保证大数据分析和后期可视化至发表阶段所需的技能。我们在文后提供了学习视频供提前预习。当你利用几个小时,走进大数据分析和可视化的大门后,你将发现一个全新的世界。很多人会感觉相见恨晚,爱上分析,从此走向人生的快车道。即使你对编程不感兴趣,这里面用到的理念也定能让你受益终身,在今后相关分析中事半功倍,比别人更胜一筹。再说现在连小学生都学Python了,再不会,孩子都带不好了。

  图表解读和绘制专题针对很多老师缺少系统的生信背景,看不懂分析文章图表,更对绘制各式图表手足无措的情况,在培训时,我们将结合发表的高水平文章,进一步讲解16种常用分析图的原理和应用限制范围,让你不仅读懂图,更知道怎么应用于自己的研究,并亲自轻轻松松完成绘图。针对大家使用R语言绘图学习时间成本比较高的问题,易生信团队针对常用16种图开发了免费绘图网站

  文章发表图的修改和排版讲演了部分图形编辑和排版操作,本次培训也会实践从原始图形、到细节修饰再到排版发表的整一个完整的过程和需要注意的几点。转录组高级分析

  转录组的应用、设计和案例分享转录组是很常规的分析,也是入门高通量测序分析的基础。这部分涵盖整个高通量测序技术的应用,高通量测序技术的实验原则包括测序通量、测序批次、测序原理等。

  转录本组装、选择性剪接分析和非编码RNA鉴定目标基因GSEA/GO富集分析

  高级转录组分析和可视化的全套流程 3,应用于所有的领域的分析经验、代码和发表级别的结果可视化

  线上线下同步开课,线上采用腾讯会议直播。整一个完整的过程都会录屏,视频可无限期观看,供后续反复观看学习。

  开课3个工作日 (含) 前申请退款退还70%的费用 (若已开发票需承担对应手续费)